A área de Higiene Urbana da autarquia conta, desde o dia 16 de dezembro de 2010, com o Certificado do Sistema de Gestão da Qualidade (ISO 9001:2008). A distinção da área de Higiene Urbana é o reconhecimento do esforço desenvolvido pela limpeza pública do município, com elevados padrões de qualidade e que pretende corresponder às necessidades e exigências da população.

Veja a reportagem da cerimónia de entrega do certificado no canal do município no Youtube.

Diariamente, mais de duas centenas de funcionários trabalham para garantir a manutenção e limpeza dos espaços públicos do município. Um trabalho que passa por uma gestão integrada da varredura urbana, recolha dos resíduos sólidos urbanos, recolha de entulhos e monos domésticos, desmatação de terrenos e estradas municipais.

Agora, a partir do site Mapas do Concelho - Limpeza Urbana, é possível obter todas as informações sobre a localização dos contentores, ecopontos e papeleiras existentes. Pode também conhecer os sistemas e a periodicidade da varredura manual e mecânica, bem como conhecer o Planeamento de Limpeza Urbana.

Este espaço tem uma vertente interativa, onde através do preenchimento de um formulário se podem deixar sugestões ou reclamações sobre o Planeamento de Limpeza Urbana.

O Seixal possui um Plano Integrado de Limpeza Urbana do Município do Seixal (PIL) que dá resposta à necessidade de articular e otimizar os serviços de limpeza.

O PIL assenta nos seguintes objetivos operacionais:
- Incutir boas práticas nos trabalhadores municipais;
- Assegurar as condições de higiene pública no município, reduzindo os tempos de permanência dos resíduos na via pública;
- Adaptar os sistemas de deposição e remoção dos resíduos às características físicas e sociais das várias realidades do concelho;
- Contribuir para a introdução de comportamentos ambientalmente corretos no quotidiano dos cidadãos.